Przyczyny powstawania aft są różne i często trudno je określić jednoznacznie.
W pewnych warunkach afty występują częściej niż zwykle.
Afty powstają najczęściej na skutek:
- mechanicznych uszkodzeń wewnątrz jamy ustnej (często w trakcie wizyty u stomatologa lub mycia zębów, także od nieodpowiednio dobranej protezy zębowej czy aparatów ortodontycznych)
- chorób zębów (takich jak, np. próchnica, kamień, zapalenie miazgi)
- niedostatecznej higieny jamy ustnej (spożywanie nieumytych produktów, obgryzanie paznokci, kontakt przedmiotów codziennego użytku z jamą ustną)
- stresu, zmęczenia i zaburzeń autoimmunologicznych
- alergii pokarmowych, nietolerancji wybranych produktów, nadwrażliwości
- stosowania lekarstw, głównie antybiotyków
- predyspozycji genetycznych
- autoagresji, przygryzania tkanki wewnątrz jamy ustnej
- zmian hormonalnych
- zapalenia zatok, choroby refluksowej, infekcji grzybiczych, choroby migdałków czy celiakii
- niedoboru witamin i składników mineralnych (żelazo, kwas foliowy, witamina B12)
- stosowania drażniących past do zębów
